En el lote donde se construyó el centro cultural Julio Mario Santo Domingo se tenía previsto construir una iglesia para la zona de San José de Bavaria. Se tomó la decisión de hacer la nueva iglesia en un lote triangular a pocas cuadras del sitio original, al norte de la calle 170 con Av, Boyacá.
La forma del lote y sus reducidas proporciones determinó fuertemente la forma de la iglesia, ya que el triangulo de terreno del que se disponía requería ser ocupado casi en su totalidad para poder albergar cómodamente todo el programa de la parroquia. El proyecto contaba con una iglesia con capacidad para 350 sentadas y 150 de pie, una sacristía, residencias para los párrocos y oficinas para la sede parroquial.
La edificación triangular resolvía el programa en 3 niveles más sótano para cuartos técnicos y parqueaderos, dónde el espacio principal de la iglesia en primer nivel estaba formado por un techo escalonado donde se iban albergando los diferentes usos complementarios y jugaban con los lucernarios orientados iluminaban cenitalmente el espacio de la capilla.